Água Fria de Goiás surgiu na década de 1940 a partir da antiga Fazenda Água Fria. O povoado cresceu com migrantes de Minas Gerais, que se dedicaram à criação de gado e ao cultivo de cana-de-açúcar. Em 1987, foi desmembrado de Planaltina de Goiás e tornou-se município, instalado oficialmente em 1989.